El recorrido se sustenta en ejemplos extraídos de la historia de los judíos gerundenses y en material arqueológico y documental relativo a la comunidad de Girona o procedente de otros sitios de Europa. El Museo ha sido ideado y diseñado para contener la mayor y más detallada información relativa a las comunidades judías medievales que se pueda localizar en un centro público en el Estado español. Expone una de las colecciones de lápidas más espectacular, junto con otros ejemplos de cultura judía.